Elke editie van Stripdagen Haarlem heeft een of meerdere hoofdthema's waardoor een podium geboden wordt aan beeldverhalen uit een onderbelichte regio of land. De hoofdthema's van de afgelopen edities waren:
- 2002 - Strips onder Stroom, Verbonden Beelde een Ecole Pigalle
- 2004 - "Waar gebeurd"
- 2006 - Scandinavië
- 2008 - Wheels & Wallonië ( en Brussel)
- 2010 - Oost Europa
- 2012 - Arabische beeldverhaal & Stripatlas
- 2014 - De Eerst Wereldoorlog & De Nieuwe Garde (opkomend Nederlands tekentalent)
- 2016 - Underground in beeld & De Schilder getekend
- 2018 - De maakbare mens - 200 jaar Frankenstein
- 2020 - Vanwege pandemie geen stripdagen Haarlem
- 2022 - Wereldbouwers